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Das Forschungsprofil der OVGU ist geprägt durch Exzellenzschwerpunkte, Sonderforschungsbereiche, Graduiertenkollegs und Forschergruppen. Externe Kooperationen bestehen mit angegliederten Zentren, An-Instituten und außeruniversitären Forschungseinrichtungen.

• Neurowissenschaften (Center for behavioral brain sciences - CBBS):
       Beteiligte Fakultäten/Partner: FNW, FME, Leibniz-Institut für Neurobiologie Magdeburg
• Dynamische Systeme (Center Dynamic Systems: Biosystems Engineering - CDS)
        Beteiligte Fakultäten: FVST, FEIT, FMA, FNW, FME, Max-Plank-Institut DKTS
• Automotive:
       Beteiligte Fakultäten: FMB, FIN, FNW

• Medizintechnik
• Erneuerbare Energien
• Mikrosystemtechnik
• Wirbelschichttechnologien